男性Y染色体长臂远侧由异染色质构成，如用荧光染料染色时，可出现强荧光。

　　可数100个细胞，计算阳性率，男胎的Y小体＞50％，大于10％判为男胎；女胎的Y小体占0％～1％，小于5％则判为女胎。

　　临床上检查Y小体，也关联到X连锁遗传病，如血友病等只在男性发病，而女性为致病基因携带者，其他意义可参阅X小体检查节。此外，对两性畸形的鉴别也有帮助。男性假两性畸形的Y小体阳性；XYY综合征的Y小体为双阳性；先天性睾丸发育不全的Y小体阳性；女性假两性畸形的Y小体为阴性。